【摘要】新药专项的管理实质上是项目承担者与项目管理者之间的决策博弈，为此，跳出传统单一线性绩效管理模式，从关注全局和有意义创新视角研究我国“重大新药创制”科技重大专项（以下简称“新药专项”）如何实现有为政府与有效市场。基于政府-市场的二元管理框架，从政府失灵与市场失灵出发，识别出需要实现对知识、人员、时间要素的综合管控是新药专项管理的关键成功要素，构建此三要素的三维分析矩阵，并聚焦科研管理人员与项目承担者构建演化博弈矩阵，推演达到管理优化稳定的策略，得出主要发力点在于降低决策误差和加强成果实现。因此，对于管理受国家财政资助的科研项目，需要明确一般性分析框架、优化评议方式、处理好成果产出与其商业化运作之间的衔接，以切实提升项目管理绩效。