黑鲷scd1a和scd1b基因克隆及其对急性低温的应答
2022-02-15分类号:S917.4
【部门】江苏省海洋水产研究所江苏省鱼类遗传育种重点实验室 水产科学国家级实验教学示范中心上海海洋大学
【摘要】为探究硬脂酰辅酶A去饱和酶-1 (stearoyl-CoA desaturase 1, SCD1)在黑鲷(Acanthopagrus schlegelii)响应低温过程中的作用,利用cDNA末端快速扩增法(rapid amplification of cDNA ends, RACE)获得了黑鲷scd1a (Asscd1a)和scd1b(Asscd1b)基因的cDNA全长序列,并检测了其在急性低温胁迫下不同组织中的表达情况。以19.8℃为对照组, 6℃为胁迫组进行低温胁迫(以1℃/h的速度降温,下降至6℃并保持24 h),在胁迫状态下能正常游动的为耐受组,失衡状态的黑鲷为敏感组。结果表明, scd1a的cDNA全长为3281 bp (GenBank No. MZ004439),包括111 bp的5′UTR、2162 bp的3′UTR和1008 bp完整开放阅读框,共编码335个氨基酸; scd1b基因cDNA全长为1560 bp(GenBankNo.MZ004440),包括152bp的5′UTR、400bp的3′UTR和1008bp完整开放阅读框,共编码335个氨基酸。多重序列比对结果显示,黑鲷与其他硬骨鱼类scd基因的氨基酸序列有较高的相似度(70%~98%),均含有3个高度保守的组氨酸元件。系统进化树分析表明,黑鲷scd1a和scd1b基因编码氨基酸序列分别与黄鳍鲷的SCD和SCDb聚为一簇,两者之间有着较近的进化关系。正常水温下,Asscd1a和Asscd1b主要在肝脏中表达,脑中弱表达,鳃中不表达;低温胁迫下, Asscd1a在肝脏中的表达前期受到抑制,后期显著上调,而Asscd1b在肝脏中则呈现表达持续上调的趋势,且上调幅度远高于scd1a;Asscd1a和Asscd1b在脑的表达均受到抑制;鳃中Asscd1a和Asscd1b均显著上调;耐受组Asscd1基因的两种亚型在肝脏、脑和鳃3个组织中的表达均比敏感组变化更为迅速。Asscd1a和Asscd1b剧烈变化的表达量说明其在黑鲷低温响应过程中发挥重要作用。
【关键词】黑鲷 scd1基因 低温胁迫 基因克隆
【基金】江苏省农业重大新品种创制项目(PZCZ201744);; 江苏省“333工程”科研资助项目(BRA2020372);; 江苏省自然科学基金项目(BK20181202);; 江苏省水产良种保种及亲本更新项目(2021-SJ-032)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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