基于Cyt b、ND1及ND2的DNA条形码在(鱼师)属鱼类物种鉴定中的应用
2021-12-23分类号:S917.4
【部门】浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心 中国水产科学研究院黄海水产研究所青岛海洋科学与技术试点国家实验室深蓝渔业工程联合实验室 海阳市黄海水产有限公司
【摘要】为建立我国(鱼师)属鱼类快速有效的分子鉴别技术,从DNA条形码角度出发,分析了线粒体细胞色素b (Cyt b)、NADH脱氢酶(ND1和ND2)基因在黄条(鱼师) (Seriola aureovittata)、高体(鱼师) (Seriola dumerili)和五条(鱼师) (Seriola quinqueradiata)等(鱼师)属鱼类物种鉴定和系统进化以及地理区域鉴别中的适用性。结果显示,Cyt b基因表现出明显的A+T偏倚性,ND2基因序列突变速率较高,变异率为20.52%,ND2基因(H_(d)=0.900, P_(i)=0.082)的遗传多样性高于ND1 (H_(d)=0.874, P_(i)=0.077)和Cyt b (H_(d)=0.814,P_(i)=0.061)。比较了(鱼师)属鱼类3种基因序列的结构特征,基于ND1和ND2基因计算的(鱼师)属鱼类种间遗传距离都为种内遗传距离的10倍以上,但Cyt b基因对高体(鱼师)和几内亚(鱼师) (Seriola carpenteri)辨识力不足。系统进化分析显示,每个物种都形成单系分支,3个基因均能对我国3种(鱼师)属鱼类进行鉴别,且都可有效区别来自全球3个不同水域的黄条(鱼师)种群。因此,Cyt b、ND1和ND2基因不仅可作为(鱼师)属鱼类物种鉴定的有效DNA条形码,还可作为不同地理种群划分和种质资源科学保护的依据,为我国(鱼师)鱼养殖产业的持续健康发展和种质资源的可持续利用提供技术依据。
【关键词】(鱼师)属鱼类 DNA条形码 物种鉴定 系统进化分析
【基金】国家重点研发计划项目(2019YFD0900901; 2018YFD0901204);; 山东省支持青岛海洋科学与技术试点国家实验室重大科技专项(2018SDKJ0303-1);; 中国水产科学研究院基本科研业务费(TD47; 2021GH05);; 中国水产科学研究院黄海水产研究所基本科研业务费(20603022021011);; 国家海洋水产种质资源库项目和财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系(CARS-47)共同资助
【所属期刊栏目】渔业科学进展
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