蓝尾蝾螈皮肤转录组及活性多肽分析
2022-01-11分类号：Q953
【部门】衡阳师范学院生命科学与环境学院 衡阳师范学院南岳山区生物资源保护与利用湖南省重点实验室 东华理工大学江西省质谱科学与仪器重点实验室 湖南师范大学动物多肽药物国家地方联合工程实验室
【摘要】通过对蓝尾蝾螈皮肤进行转录组测序,首次报道了蓝尾蝾螈皮肤的转录组及其活性多肽成分.采用Illumina Hiseq4000共测定了6.65 Gb数据;组装和去冗余后共获得75 462个unigene,其N50、GC含量、平均长度、总长度分别为1 617 bp、45.64%、818 bp、61 801 999 bp.通过基因注释,共获得34 850个非冗余注释unigene(占unigene总数的46.18%),注释结果为两栖类物种的unigene数目约占注释总数的16%.根据unigene的COG和GO注释结果,统计了各自的功能分类.其中,对鉴定到的多种活性多肽进行了初步的生物信息学分析,为诠释蓝尾蝾螈皮肤生理学功能提供依据.
【关键词】蓝尾蝾螈 转录组测序 活性多肽 基因注释 生理学功能
【基金】国家自然科学基金项目(31201718,31402025);; 长江学者和创新团队发展计划项目(IRT13054);; 湖南省生物发育工程及新产品研发协同中心项目(20134486);; 衡阳师范学院科学基金科研项目(18D16);; “南岳山区生物资源保护与利用”湖南省重点实验室开放基金项目(NY20K05);; 湖南省教育厅科学研究项目(20C0273)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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