【摘要】基于全基因组重测序技术开发的SNP标记，对香樟及近缘种的亲缘关系进行分析，结果表明，通过对16个香樟无性系和2个近缘种进行重测序分析，共获得209 Gb原始数据，平均有效测序深度16×.共获得约209 308 831个高质量SNP,纯合SNP共165 814 908个，杂合SNP共43 493 923个.由系统进化树可知11份芳樟无性系聚在一起，3份芳樟无性系与油樟聚在一起，然后与龙脑樟聚在一起，沉水樟和肉桂先被分离出来；通过主成分分析将16份香樟无性系分为3类，分别为芳樟类群、龙脑樟和油樟类群；芳樟、龙脑樟和油樟精油成分存在差异，为不同的化学利用类型.