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高通量单细胞转录组数据分析方法的研究进展

2022-03-18分类号:Q811.4

【作者】李涛  张泽坤  顾连峰  
【部门】福建农林大学林学院  福建农林大学海峡联合研究院基础林学与蛋白质组学中心  
【摘要】单细胞转录组测序(scRNA-seq)使研究人员能够在单细胞分辨率下研究基因的表达,了解细胞的动态发育轨迹.然而,单细胞分辨率的基因表达矩阵往往具有高维度和高稀疏性的特点,使后续数据处理面临巨大的挑战.因此,本文综述了scRNA-seq数据分析的一般流程和常用软件,这将有助于研究人员选择更合适的分析软件和流程.
【关键词】单细胞转录组测序  降噪  高通量  聚类  注释
【基金】福建省林木种苗科技攻关六期项目(201904);; 国家自然科学基金项目(31971734)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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