茶树TPP基因家族的鉴定及其对低温胁迫的响应
2021-12-17分类号:S571.1
【部门】南京农业大学园艺学院
【摘要】[目的]本文旨在鉴定茶树海藻糖-6-磷酸磷酸酶(TPP)基因家族,并探索其在茶树抵御低温胁迫调控中的功能。[方法]利用生物信息学的方法,对茶树TPP基因家族进行进化树、保守结构域、启动子顺式元件等特性进行分析;通过茶树TPP基因家族的组织特异性表达及其对低温胁迫的响应,初步探讨CsTPP的生物学功能。[结果]从茶树基因组中鉴定到12条具有Trehalose-PPase保守结构域的CsTPP序列。系统进化树分析表明,根据与拟南芥、水稻的TPP基因同源性差异比较,可以将CsTPP分成3组。启动子顺式元件分析表明,CsTPP的启动子区含有多个胁迫响应相关元件和激素响应相关元件。基因表达分析显示,12个CsTPP基因在不同组织的表达量差异较大,具有明显的组织表达特异性。低温胁迫响应分析显示,4个CsTPP基因可能参与茶树叶片响应低温胁迫过程。[结论]CsTPP基因家族可能参与茶树响应低温胁迫的过程。
【关键词】茶树 海藻糖-6-磷酸磷酸酶(TPP) 低温胁迫 RT-qPCR
【基金】中国博士后科学基金项目(2020M681636);; 国家现代农业产业技术体系项目(CARS-19);; 江苏省重点研发计划项目(BE2019379);; 江苏省农业科技自主创新资金[CX(20)2004];; 江苏高校优势学科建设工程资助项目
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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