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种子动态萌发表型分析算法的研究和软件实现

2022-03-01分类号:S126;S330.2

【作者】赵建华  周洁  丁国辉  孙港  徐凌翔  关雪莹  周济  
【部门】南京农业大学前沿交叉研究院/作物表型组学交叉研究中心  南京农业大学人工智能学院  浙江大学农业与生物技术学院  英国国立农业植物研究所/英国剑桥作物研究中心  
【摘要】[目的]种子是植物研究中重要的对象之一,对种子萌发表型的动态监测为了解不同植物生存、生长和繁衍提供了重要依据。本研究提出了一种结合自动化图像处理、图论和监督式机器学习的方法,实现了对种子关键萌发表型的量化分析。[方法]以禾本科植物小麦(Triticum aestivum)为研究对象,利用监督式机器学习算法(如K近邻、支持向量机、随机森林),在不同颜色空间上对三种弱筋小麦品种的种子萌发图像序列进行前、背景对象训练及背景分割,然后通过构建自动化图像处理算法进行目标提取,再结合图论和二维骨架动态分析幼根和根尖点的位置变化,实现关键萌发性状的高通量数字化提取。[结果]本研究可获得大量人工难以计量的萌发性状,包括种子长、宽、面积、周长,幼根和幼芽长度及生长速率等。通过与人工统计数据的线性回归分析,关键动态性状如幼根长、根生长速率、芽长的决定系数R~(2)值分别为0.922(n =188,P< 0.001,RMSE=0.406)、0.897(n=115,P
【关键词】种子萌发  动态表型分析  自动化图像处理  监督式机器学习  小麦
【基金】江苏省基础研究计划(BK20191311);; 中央高校基本科研专项资金(JCQY201902)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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