【摘要】【目的】为了解施用不同梯度氮磷钾推荐用量下对烟田土壤细菌群落的物种多样性的影响。【方法】从云南省澄江县烟区采集不同推荐施肥用量处理中的土壤样品，提取土壤总DNA并利用16S rRNA高通量测序技术及生物信息学分析法进行统计分析。【结果】在烟田中不同施肥处理条件下土壤细菌域有7个优势种群，依次为变形菌门(Proteobacteria)，酸杆菌门(Acidobacteria)，放线菌门(Actinobacteria)，拟杆菌门（Bacteroidetes），芽单胞菌门（Gemmatimonadetes），绿弯菌门(Chloroflexi)，厚壁菌门（Firmicutes），这些优势群落占所有有效序列的90%以上。相对于不同氮、钾梯度施用量，不同磷梯度的养分用量对烟田土壤细菌群落的多样性具有显著影响。在磷施用量为67.5 kg/hm~(2)处理条件下，土壤微生物3个α多样性指数最低即OUT=1494（P=0.067），Shannon=5.98（P=0.016)和Simpson=0.9891（P=0.043）。通过不同养分互作条件下优势种群变形菌门α多样性的比较发现，在N=90 kg/hm~(2)的处理中，磷钾不同养分梯度组合可显著改变土壤优势种群变形菌门的多样性，其中当磷的施用量为45 kg/hm~(2)，钾的施用量为405 kg/hm~(2)时，变形菌门的Shannon指数和Simpson指数最低，分别为4.640（P=0.049）和0.967（P=0.053），其中当磷的施用量为22.5 kg/hm~(2)，钾的施用量为270 kg/hm~(2)时，变形菌门的Shannon指数和Simpson指数最高，分别为4.87（P=0.049）和0.976（P=0.053）。在P=45 kg/hm~(2)的处理中，不同氮、钾组合梯度下，未发现显著改变土壤优势种群变形菌门的α多样性指数的效应，但是当氮和钾（N_(2)K_(3)）施用量分别为90 kg/hm~(2)和405 kg/hm~(2)时，变形菌门的Shannon指数和Simpson指数分别为4.640（P=0.370）和0.967（P=0.444），相对低于其他处理组。【结论】不同施肥制度能够通过改变土壤性质影响土壤微生物群落的结构和功能特征。