中华绒螯蟹代谢蛋白互作网络构建及分子功能、亚细胞定位和途径分析
2022-03-28分类号:S917.4
【部门】天津师范大学生命科学学院天津市动植物抗性重点实验室
【摘要】为了构建中华绒螯蟹代谢过程研究的系统工具,实验在已经构建的中华绒螯蟹蛋白互作网络的基础上,首先采用邻接节点注释法对未知蛋白的分子功能进行预测。随后采用GO回溯法,构建了代谢蛋白网络并对网络中蛋白分子功能、亚细胞定位和途径分布进行了分析。分子功能注释中,确定了932 个蛋白的分子功能,占所有未知分子功能蛋白的97%。最终构建的代谢蛋白互作网络包含2 045 个蛋白及这些蛋白之间的15 927 条互作关系。网络中94.2%(1 926/2 045)的蛋白具有亚细胞定位信息,大多分布于有膜细胞器中;96.1%的蛋白(1 966/2 045)具有分子功能信息,大多具有催化活性和结合活性。进一步对确定了分子功能和亚细胞定位的蛋白在40 个KEGG子系统中的分布进行分析,发现参与翻译和氨基酸代谢过程的蛋白较多,也有一部分参与免疫和运输过程。本文的研究结果可为中华绒螯蟹代谢相关的蛋白功能、定位方面的研究提供重要的数据参考,对系统研究中华绒螯蟹代谢过程及代谢相关疾病具有重要价值。
【关键词】中华绒螯蟹 蛋白互作网络 分子功能 亚细胞定位 代谢
【基金】国家重点研发计划(2018YFD0901301);; 国家自然科学基金(31770904);; 天津市人才发展特殊支持计划高层次创新创业团队项目(ITTFRS2017007);; 天津市高等学校创新团队建设规划(TD13-5076);; 天津市自然科学基金(19JCYBJC29700)
【所属期刊栏目】水产学报
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