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曼地亚红豆杉NAC基因家族鉴定及表达分析

2022-03-28分类号:S791.49

【作者】张恺恺  杨立莹  丰美静  张林凤  陈段芬  邱德有  杨艳芳  
【部门】中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室  中国花卉协会  河北农业大学园艺学院  
【摘要】[目的]筛选红豆杉NAC转录因子家族中影响根系形成的关键基因,探索红豆杉根系生长发育分子机理。[方法]利用曼地亚红豆杉全长转录组数据,通过生物信息学方法鉴定NAC转录因子,并对筛选出的NAC转录因子进行蛋白结构及基因组织表达谱等分析。[结果]共鉴定出44个NAC转录因子,其在N端均具有典型的保守NAC结构域,分别聚类到拟南芥的7个亚家族中,蛋白三级结构较为相似,且成员大多含有5个保守亚结构域。组织表达谱显示TmNAC15、16、18、21、22、29、39、40、41和44在根中表达水平高于茎和叶。[结论]从曼地亚红豆杉中共鉴定出44个NAC转录因子,其结构较为保守,且聚类为7个亚家族,其中成员TmNAC21、22、39、40和44极有可能参与红豆杉根系生长发育。
【关键词】红豆杉  NAC基因  基因鉴定  表达分析
【基金】“十三五”国家重点研发计划子课题“红豆杉高效培育技术研究”(2017YFD060070605);; 国家林业和草原局科技发展中心项目(KJZXSA202037);; 国家自然科学基金项目(31570675)项目资助
【所属期刊栏目】林业科学研究
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