【摘要】监测条子泥垦区养殖尾水净化河道内的水体和沉积物，以探究河道内的细菌群落结构及与环境因子的关系。结果表明，河道内水质在不同月份间的差异显著，沉积物的理化性质在不同位点间的差异显著（P<0.05）。依总氮（TN）和总磷（TP）判断，河道水体处于富营养化水平，但满足江苏省池塘养殖尾水排放二级标准。碳酸氢钠可提取磷（Olsen-P）表明沉积物不处于高营养水平。水体和沉积物中细菌群落组成的变化同理化性质一致，两环境中细菌群落的多样性、丰富度和组成均存在显著差异（P<0.05）。蓝细菌门（Cyanobacteria）是水中的优势菌门之一，在9月份水体中的相对丰度高达39.33%。蓝细菌属（Cyanobium＿PCC-6307）在水体（13.34%）和沉积物（8.15%）中均占据最高丰度，对细菌群落的影响最大。水体中水温（T）、TN、可溶性活性磷酸盐（SRP）和高锰酸盐指数（COD_(Mn)）与细菌群落显著相关（P<0.05）。除TN外，其余3项指标均与蓝细菌属呈正相关。沉积物中水溶性磷（WSP）、易解析磷（RDP）和总碳（TC）与细菌群落显著相关（P<0.05），WSP和RDP与蓝细菌属呈正相关。应加强对养殖尾水中磷的控制，以限制蓝细菌属在河道中的富集。本研究为沿海垦区水产养殖的尾水调控和健康发展提供了参考。