【摘要】国家高新区创新效率是观测我国创新整体发展水平的重要窗口。研究采用数据包络分析方法 （DEA）和曼奎斯特指数（Malmquist index），对我国国家高新区的静态与动态创新效率进行测算，并利用逐步回归方法，探索影响国家高新区创新效率的主要城市环境因素。研究发现：我国国家高新区创新效率的整体水平不高，呈现波动式上升趋势，规模效率均值高于纯技术效率均值；虽然技术效率变化均值为正，但由于技术进步的迟滞效应，导致了全要素生产率的下降；城市对外开放水平对综合技术效率和规模效率均具有正向的积极作用，城市金融发展水平对纯技术效率具有正向影响，城市科技财政水平对创新效率具有显著的负向影响。据此，提出了扩大城市对外开放水平、提升城市金融发展水平与优化城市科技财政支出等建议，以进一步推动国家高新区创新效率的提升。