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绒山羊胎儿期毛囊发生发育关键circRNA的鉴定及功能预测分析

2022-03-15分类号:S827

【作者】尚方正  马荣  戎友俊  王敏  潘剑锋  梁丽丽  张燕军  李金泉  
【部门】内蒙古农业大学动物科学学院  农业部肉羊遗传育种重点实验室  内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室  内蒙古自治区山羊遗传育种工程技术研究中心  
【摘要】为探究调控绒山羊毛囊发生发育阶段关键circRNA及其功能,基于课题组前期得到的内蒙古绒山羊胎儿期(45、55、65和75d)皮肤组织circRNA表达谱以及各比对组中差异表达circRNA的基础,根据不同时期毛囊形态发生发育情况筛选了毛囊发生发育相关的circRNA,利用生物信息学分析毛囊发生发育关键circRNA,并对其进行qRT-PCR试验;运用TargetScan和miRanda预测关键circRNA靶向的miRNA以及靶向miRNA的靶基因,分析了22个内含子circRNA宿主基因的富集情况,探究circRNA的功能作用。结果表明:1)通过生物信息学分析,circRNA2049、circRNA5681、circRNA2225和circRNA3411均由外显子组成,为外显子circRNA。2)qRT-PCR显示,circRNA2049、circRNA2225、circRNA3411和circRNA5681在绒山羊胎儿期4个时期(45、55、65和75d)中均显著差异表达(P<0.05)。3)功能分析显示,外显子circRNA可能竞争性结合miRNA,以circRNA-miRNA-mRNA调控网络来调控毛囊的发生发育,同时内含子circRNA宿主基因也可能影响毛囊的发生发育,具体作用机制需后续探究。综上,本研究筛选鉴定了绒山羊毛囊发生发育关键circNRA,并初步探究了其功能,为解析circRNA在绒山羊毛囊发育过程中的分子机制提供了理论基础,为研究绒毛生长发育提供了新的方向。
【关键词】绒山羊  毛囊  circRNA  功能分析
【基金】国家自然科学基金项目(31860627);; 内蒙古自治区科技重大专项项目(2021ZD0012);; 内蒙古自治区科技计划项目(2019GG243)
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
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