怀玉山高山马铃薯脱落酸和环境胁迫诱导蛋白基因的克隆和序列分析
2021-06-28分类号:S532
【部门】上饶师范学院生命科学学院 上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室 上饶市薯芋类作物种质保存与利用重点实验室 上饶农业技术创新研究院 上饶市红日农业开发有限公司
【摘要】【目的】对怀玉山高山马铃薯脱落酸和环境胁迫诱导蛋白基因进行克隆和序列分析,为揭示怀玉山马铃薯脱落酸和环境胁迫诱导蛋白的生物学功能提供理论依据。【方法】通过怀玉山高山马铃薯试管苗转录组数据库筛选到脱落酸与环境胁迫诱导蛋白基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山高山马铃薯脱落酸与环境胁迫诱导蛋白基因,并采用生物信息学方法进行序列分析。【结果】怀玉山高山马铃薯脱落酸与环境胁迫诱导蛋白基因cDNA总长度为423 bp, G+C含量为52.25%;怀玉山高山马铃薯脱落酸与环境胁迫诱导蛋白由140个氨基酸组成,分子量14 534.01Da,等电点7.07,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(21.43%)、β-片层(24.29%)、无规则卷曲(54.29%)构成;三级结构为单聚体,主要存在细胞核中。怀玉山高山马铃薯脱落酸与环境胁迫诱导蛋白在进化上与马铃薯(Solanum ltuberosum)和副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus)的亲缘关系较近,尤其是与马铃薯(S.ltuberosum)TAS14-like在进化上具有最高的亲缘关系。【结论】怀玉山高山马铃薯脱落酸与环境胁迫诱导蛋白基因具有典型脱落酸与环境胁迫诱导蛋白基因的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,在进化上高度保守,对进一步揭示该酶生物学功能具有重要意义。
【关键词】怀玉山高山马铃薯 试管苗 ABA和环境胁迫诱导蛋白基因 克隆 序列分析
【基金】江西省2019年度重点研发计划项目(20192BBF6 0006);; 江西省2020年度重点研发计划项目(20202BBF63001);; 上饶市科技局平台载体建设项目(2020I001);上饶市科技局平台载体建设项目(2019I017);; 2020年江西省大学生创新创业训练计划项目(2020-CX-07)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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