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绿豆Dof家族基因的生物信息学分析及盐胁迫下的表达分析

2021-06-28分类号:S522

【作者】张文慧  杜吉到  贺登美  谷心茹  黄勇  国凤双  
【部门】黑龙江八一农垦大学农学院  
【摘要】【目的】Dof家族基因是植物特有的一类转录因子,在植物的生长发育、细胞的防御反应等方面具有重要的调控作用。【方法】本文从绿豆转录组数据库中筛选出41条Dof基因,对其蛋白序列进行生物信息学分析和盐胁迫下表达分析。【结果】Dof基因分布在除6号染色体外的1~11号染色体上,都具有1个高度保守的结构域;Dof蛋白含有5~28个磷酸化位点,并且都定位在细胞核里;系统进化分析将Dof基因分为8个组别,分析发现相同组别的Dof基因有相似的基因结构和蛋白基序,而不同组别间则存在差异;Dof基因能够响应盐胁迫,但不同胁迫时间基因间的表达模式存在差异,同组别的基因表达模式存在一定程度的相似性。【结论】相同组别的Dof基因具有相似的基因结构和蛋白基序,推测它们有相似的生物学功能。Dof基因能够不同程度响应盐胁迫,说明它们在绿豆抵御盐胁迫中发挥不同作用,这些分析结果将为绿豆Dof基因功能研究提供参考。
【关键词】绿豆  Dof基因  生物信息学  基因表达
【基金】杂粮种质资源保护与品种选育项目(2042070001);; 黑龙江省大学生创新创业训练计划项目(201910223052);; 国家自然科学基金项目(31600532)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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