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Streptomyces sp. DJ菌株产生的角蛋白酶的序列分析

2021-10-28分类号:Q811.4

【作者】柯野  杨家臣  屈奇奇  袁小枚  黄镜如  
【部门】韶关学院英东生物与农业学院  
【摘要】【目的】解析Streptomyces sp. DJ菌株编码的3种角蛋白酶的氨基酸序列、二级结构、三级结构及其功能的关系。【方法】基于DJ菌株全基因组测序结果,利用Bio-edit、DNAMAN、Discovery Studio2.5等软件、https://swissmodel.expasy.org/等网站对其3种角蛋白酶的序列和结构进行了分析和预测。【结果】DJ菌株胞外分泌3种角蛋白酶(K1、K2和K3)均属于S8家族的丝氨酸蛋白酶,信号肽、前导肽和成熟肽在氨基酸残基的组成、极性和长度等方面较一致。3种酶均能以5WSL.1.A为模板进行同源建模,每种酶的3-D结构中均含有6个α螺旋、2个3_(10 )α螺旋和15个β折叠的二级结构;其中K1酶含有2个二硫键,1Ca和2Ca位点,K2和K3各有1个二硫键,1Ca位点;3种酶的Pro270残基位于loop环,而仅有K2的Pro242残基位于loop环中。3种酶底物结合区域主要由疏水性残基构成,偏向于疏水性强的底物。3种酶的底物结合区域比较而言,S1和S2对底物特异性起关键作用;由于3种酶的S1和S2中重要位点残基的不保守性,使其底物特异性具有差异。【结论】DJ菌株中3种角蛋白酶在氨基酸、二硫键、脯氨酸和钙结合等的不同致使酶稳定性的不同;并且由于其表面电荷分布、底物结合区域的差异构成对羽毛水解位点的互补性,这可能是DJ菌株高效降解羽毛的重要原因。
【关键词】Streptomyces sp. DJ菌株  全基因组测序  角蛋白酶  序列分析
【基金】广东省基础与应用基础研究基金(2019A1515 011089);; 韶关市科技计划项目(2018sn087);; 2018韶关学院大学生创新创业训练计划国家级项目(201810576007);; 广东大学生科技创新培育专项资金资助项目(pdjh2020b0536)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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