油橄榄WRKY转录因子的全基因组鉴定与分析
2021-11-18分类号:S565.7
【部门】西南林业大学林学院 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室
【摘要】以干旱和水淹胁迫下的‘佛奥’和‘TYZ-1号’2个品种苗木为试材,基于油橄榄全基因组数据,鉴定出106个油橄榄WRKYGQK七肽结构蛋白(WRKY)基因家族成员.利用生物信息学软件进行结构和功能预测,结合油橄榄水分(干旱、水淹)胁迫基因表达谱,分析出7个WRKY转录因子(WRKY14、WRKY51、WRKY77、WRKY91、WRKY66、WRKY1、WRKY92)在‘佛奥’和‘TYZ-1号’中均有高度表达且共同参与干旱和水淹胁迫调控,推测这7个基因可能是油橄榄水分胁迫的主要调节因子.将WRKY蛋白与已知干旱调控的WRKY转录因子构建系统进化树,结果显示,7个与胁迫相关的转录因子中的4个(WRKY14、WRKY51、WRKY91、WRKY92)与已知干旱调控的WRKY基因相似度更高,推测这4个WRKY转录因子可能是参与‘TYZ-1号’干旱调控的主要基因.
【关键词】油橄榄 WRKY转录因子 生物信息学 基因表达谱 水分胁迫
【基金】中央财政林草技术推广项目(云【2021】TG01号);; “十三五”国家重点研发计划项目(2020YFD1000703);; 云南省林业和草原科学院创新团队基金项目(LKYTD-2020-001)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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