苦荞FtERD家族糖转运基因的鉴定与分析
2021-11-18分类号：S517
【部门】贵州师范大学生命科学学院荞麦产业技术研究中心
【摘要】利用生物信息学方法筛选鉴定出28个FtERDs糖转运基因,其中19个编码蛋白序列且具有跨膜结构域.聚类分析将FtERDs归为4类,类Ⅰ包括13个,类Ⅱ包括9个,类Ⅲ包括1个,类Ⅳ包括5个.转录组测序检测到22个FtERDs在茎中表达,17个为差异表达基因(DEGs),其中仅3个DEGs在苗期10和15 d同时高表达,其余有3个DEGs在5 d高表达,2个DEGs在10 d高表达,9个DEGs在15 d高表达.这些基因可能在不同发育阶段的茎中发挥功能.同时,FtERDs间存在多个显著正相关或负相关,推测FtERDs基因的功能可能存在协同或互补效应.PEG模拟干旱胁迫8 h时,5个FtERDs过量表达,其中FtPinG34458.01、FtPinG85532.01表达量高于对照10倍以上.
【关键词】苦荞 早期脱水响应基因 糖转运载体 生物信息学 基因表达
【基金】国家自然科学基金项目(32060511、31660366);; 贵州省科技支撑项目(黔科合ZC[2019]2298);; 贵州师范大学博士启动基金项目;; 贵州省荞麦种质资源保育及创新重点实验室建设基金(黔教合KY[2017]002)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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