基于转录组学的巨菌草内生链霉菌拮抗玉蜀黍平脐蠕孢的分子机理
2021-09-18分类号：S476
【部门】福建农林大学国家菌草工程技术研究中心 福建农林大学植物保护学院
【摘要】通过Illumina Hiseq4000高通量测序平台,采用PE150测序策略研究了玉蜀黍平脐蠕孢在链霉菌发酵液胁迫下(S组)的转录组变化,共得到128 613 786个clean reads,筛选出4 559个差异基因.与无发酵液的对照组相比,S组中有2 283个基因表达上调,2 276个基因表达下调;从中挑选出表达量差异最大的22个基因作为内生链霉菌调控拮抗的拟关键基因,这些基因多涉及氨基酸合成和代谢以及信号转导途径,说明链霉菌发酵液对玉蜀黍平脐蠕孢的氨基酸生物合成和MAPK信号通路相关基因的影响显著;采用实时荧光定量PCR验证其中5个基因的表达量,其趋势与转录组分析结果基本一致.
【关键词】生物防治 RNA-seq 高通量测序 差异基因
【基金】中央引导地方科技发展专项(2018L3003)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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