【摘要】科研院所是我国科技创新体系的核心组成部分,对科研院所进行科学合理的政策引导和支持,能有效增强科研院所科技创新能力,提升市场服务效益,极大地促进科研院所的升级发展。本文以重庆市科研院所绩效激励引导专项为例,对重庆37家科研院所的专项创新绩效进行评估研究,发现政府引导政策可以从规范科研管理工作、提升研发水平、强化市场服务等方面对科研院所的科技发展产生积极影响,同时研究中也发现科研院所普遍存在政策理解不透彻、管理制度不完善、人才建设不足、科研产出有限、转化水平需提升等问题。因此,本文从以下方面提出工作机制完善建议:第一,引导科研院所充分解析专项政策;第二,完善科研院所的专项管理体系;第三,科学引导专项人才体系建设;第四,提高科研院所的成果产出能力;第五,强化科研院所科技成果转化。