基于GFM和GAMM模型分析对虾白斑综合征(WSSV)对黄海和东海北部水域虾类生物量的影响
2021-06-15分类号:S945.4
【部门】中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海水养殖病害防治重点实验室青岛市海水养殖流行病学与生物安保重点实验室 青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室
【摘要】虾类是海洋生态系统功能群的重要组成部分,其生物量变化受到多重因素的影响。本研究在开展黄海和东海北部水域虾类白斑综合征病毒(white spot syndrome virus, WSSV)流行病学调查的基础上,利用梯度随机森林模型(gredient forest model, GFM)和广义加性混合模型(generalized additive mixed models, GAMM),分析了2016—2018年间黄海与东海北部水域WSSV流行对虾类生物量的影响。分子检测结果显示,调查所获取的26种虾类中,11种被检测为WSSV阳性;2016、2017和2018年WSSV阳性采样站点的比率分别为48.395%、38.75%和21.74%,虾类样品中WSSV阳性检出比率分别为16.86%、9.6%和4.79%。GFM模型分析显示,解释变量“阳性样品数的对数(Ln_posi)”对响应变量“虾类生物量的对数(Ln_Abu)”的重要性最高。GAMM分析中根据赤池信息准则(Akaike information criterion, AIC)最小原则筛选出的最优模型为:Ln_Abu~WSSV阳性率(P_rate)+Ln_posi+经度(Long),该模型中Ln_posi和P_rate是影响虾类生物量的极显著相关因子,Ln_Abu随着P_rate的升高而降低。研究表明,WSSV在黄海和东海北部水域虾类中流行,推测对该海域的虾类生物量存在潜在影响。
【关键词】对虾白斑综合征病毒 黄海和东海北部 虾类 GFM模型 GAMM模型
【基金】国家重点研发计划项目(2017YFC1404503);; 农业农村部财政项目“黄渤海渔业资源调查”;; 中国水产科学研究院基本科研业务费(2020TD39);; 中国水产科学研究院黄海水产研究所级基本科研业务费项目(20603022020005)
【所属期刊栏目】渔业科学进展
文献传递