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毛竹NLP转录因子鉴定及其响应氮素的表达模式

2021-10-13分类号:S795.7

【作者】袁婷婷  朱成磊  李紫阳  宋新章  高志民  
【部门】国际竹藤中心竹藤资源基因科学与基因产业化研究所国家林业和草原局/北京市共建竹藤科学与技术重点实验室  浙江农林大学  
【摘要】[目的 ]鉴定毛竹中NLP家族成员,为深入研究毛竹NLP分子调控机制奠定基础。[方法 ]采用生物信息学方法鉴定并系统分析毛竹NLP成员的分子特征,用实时荧光定量PCR (qPCR)技术检测毛竹NLP响应氮素的表达模式。[结果 ]毛竹中鉴定出10个NLP成员(PeNLP1~PeNLP10),其蛋白长度为714~963 aa,分子量为77.41~105.08 kDa,理论等电点介于5.36~6.25之间;亚细胞定位预测结果表明,除PeNLP9定位于叶绿体外,其余成员均定位于细胞核内。系统进化分析表明:PeNLPs分成3个组,各组成员分别为4、2、4个。PeNLPs均包含4个内含子,不同成员内含子的大小和位置存在一定的差异;PeNLPs内有共线性基因对6个,PeNLPs和OsNLPs之间有共线性基因对9个,且它们的Ka/Ks均小于1,说明其在进化上经历了纯化选择。组织特异性分析表明,有的PeNLPs呈组织特异性表达,有的则呈组成型表达。PeNLPs受到氮饥饿诱导表达,在1 h内PeNLP1的表达量显著上调,其它5个PeNLPs则显著下调(p
【关键词】毛竹  NLP转录因子  家族鉴定  氮素响应
【基金】国家自然科学基金重点项目“毛竹快速生长和退笋发生的碳氮供应及机理研究”(31930075);国家自然科学基金项目“竹笋速生期水通道蛋白调控水分运输的分子机制”(31971736)
【所属期刊栏目】林业科学研究
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