标题
  • 标题
  • 作者
  • 关键词

松树内生细菌GD2对松材线虫入侵寄主时转录组的影响

2021-07-30分类号:S763.18

【作者】陈阳雪  赵晓佳  谈家金  
【部门】南京林业大学林学院  
【摘要】为了进一步阐明细菌在松材线虫病中的作用,采用松材线虫(CK)和松材线虫与马尾松内生细菌GD2的混合物(T)分别接种马尾松,对松材线虫进行转录组测序、 Gene Ontology(GO)及KEGG富集分析,并利用Real-time Quantitative PCR(RT-qPCR)验证目标基因表达情况。结果显示,与对照组(空白虫)CK相比,共筛选到143个差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),其中有63个上调基因,80个下调基因。Gene Ontology分析显示,差异表达基因在免疫系统过程、细胞膜、代谢过程、转运活性等功能类富集。KEGG通路在ECM-receptor互作、肾素-血管紧张素、糖酵解、胰岛素信号等通路富集。这些GO功能与KEGG通路涉及机体的免疫调节。选取8个基因进行RT-qPCR验证,表达水平与测序结果一致,证明了测序结果的准确性。表明菌株GD2可以通过提高松材线虫的免疫调节能力来影响松材线虫病的发生。
【关键词】转录组分析  松材线虫  马尾松内生细菌GD2  差异表达基因  线虫-细菌微生态
【基金】国家重点研发计划项目(2018YFC1200400)
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
文献传递