【摘要】为研究3类淡水养殖水体（精养虾蟹池、湖泊养殖水体和精养鱼池）细菌群落结构与硝化速率的关系，通过16S rRNA 基因高通量测序与流式细胞仪分析了15个养殖水体的细菌种群结构和总菌数，并测定了硝化速率。结果表明：淡水养殖水体中的优势菌群门为变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Acidobacteria）和拟杆菌门（Bacteroidetes），且夏季细菌群落的多样性显著高于春季（P<0.05）。春季的亚硝酸盐氧化细菌（NOB）为Nitrotoga和硝化杆菌（Nitrobacter），其中硝化杆菌的丰度与硝化速率呈显著正相关（P<0.05），且精养鱼池中NOB的丰度显著高于另两类型水体（P<0.05）；夏季NOB以硝化螺菌（Nitrospira）为主，其丰度也与硝化速率显著正相关(P<0.05)，且湖泊散养水体中NOB的丰度显著高于另两类水体（P<0.05）。此外，春夏两季节的黄单胞菌目（Xanthomonadales）的丰度均与硝化速率显著正相关。上述结果说明，养殖水中NOB的分布受季节和养殖水体类型的影响，而硝化速率则受多种细菌的共同影响。