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基于小RNA技术的天津地区番茄花叶病毒分子检测与基因组部分序列分析

2021-10-28分类号:S436.412.1

【作者】金凤媚  薛俊  孙海波  郝志愚  
【部门】天津市农业科学院  
【摘要】为了明确引起天津地区番茄果实褐化的病因,采用小RNA深度测序技术和RT-PCR技术对采自天津的番茄病样进行鉴定分析。结果表明,引起天津地区番茄果实变褐的病原为番茄花叶病毒。进一步对该病毒进行了全基因组测序,并对该病毒的外壳蛋白(CP)、运动蛋白(MP)和126蛋白进行了序列分析。进化树分析结果表明,天津分离物的3个蛋白基因均与美国分离物USA_99-1)的进化关系最近。相似性分析结果表明,CP基因与其他分离物的平均相似性为95.53%。MP基因与其他基因分离物的平均相似性为95.21%。126蛋白基因与其他分离物的平均相似性为92.72%。对这3个基因编码的蛋白进行分析,结果表明,不同分离物之间的平均相似性均在99.0%及以上。初步表明,在天津发生的番茄花叶病毒可能是由于贸易活动由国外传入天津市。
【关键词】番茄  番茄花叶病毒  小RNA深度测序  分子检测  基因序列分析
【基金】天津市农业科技成果转化与推广项目(201901020);; 天津市科技计划项目(19YFYZSN00090;21ZYCGN00420)
【所属期刊栏目】华北农学报
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