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GnIH基因多态性与鹅产蛋和体组成性状的关联分析

2021-07-27分类号:S835

【作者】高广亮  张克山  许国洋  赵献芝  陈主平  周莉  王启贵  
【部门】重庆市畜牧科学院  重庆市肉鹅遗传改良工程技术研究中心  重庆市綦江区动物疫病预防控制中心  
【摘要】为研究促性腺激素抑制激素基因(GnIH)的系列特征,以及其SNP多态性位点对四川白鹅产蛋和体组成等性状的影响,克隆了GnIH基因DNA序列,并与哺乳动物和其他禽类进行生物信息学分析;该基因DNA序列比对到鹅参考基因组序列筛选SNP位点,随后采用Sanger方法直接测序PCR产物的方法,检测四川白鹅群体(208个体)中该基因序列,该序列包含3个外显子和2个内含子,CDS区长522 bp, 173个氨基酸的前体蛋白GnIH氨基酸序。通过多重比对分析后,统计该基因在四川白鹅群体中SNP位点的基因型及其频率,进而与鹅产蛋和体组成等11个重要经济性状进行关联分析。获得了3 735 bp的GnIH基因DNA序列,遗传进化分析显示,四川白鹅GnIH基因与绿头鸭的序列相似度最高(99%);序列比对到鹅参考基因组序列发现该基存在26个SNP位点;SNP位点基因型频率与性状关联分析结果表明:该基因11个SNP位点(g.811T>C、g.1892T>C、g.1320G>A、g.1809G>T、g.2164C>G、g.1708A>G、g.2164C>G、g.1809G>T、g.1892T>C、g.1929C>A和g.2164C>G)与初产蛋质量、体斜长、颈长、胸宽和胫围等性状显著或极显著相关(P<0.05或P0.05)。四川白鹅GnIH基因序列与绿头鸭亲缘关系最相近;本研究克隆的3 735 bp的DNA序列中存在26个SNP位点,其中11个SNP位点可作为四川白鹅初产蛋质量、体斜长、颈长、胸宽和胫围等经济性状的潜在的分子标记之一。
【关键词】鹅  GnIH基因  SNPs  产蛋性状  体组成性状  分子标记辅助选择
【基金】重庆市自然科学基金面上项目(cstc2019jcyj-msxmX0072;cstc2019jcyj-msxmX0065);; 重庆市科研机构绩效激励引导专项(cstc2019jxjl80009);; 财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助(CARS-42-51);; 重庆市技术创新与应用发展专项重点项目(cstc2019jscx-gksbX0097)
【所属期刊栏目】华北农学报
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