CIDEA基因上游调控区变异对猪肌内脂肪性状的影响
2021-10-12分类号:S828.2
【部门】南京农业大学动物科技学院 新疆农业大学动物科学学院 云南农业大学动物科学技术学院
【摘要】[目的]本文旨在鉴定CIDEA基因上游调控区内与猪肌内脂肪沉积相关的单核苷酸多态性(SNP)位点,并分析关联位点对基因表达的影响,为解析CIDEA基因对猪肌内脂肪性状的影响机制提供参考。[方法]通过对猪CIDEA上游调控区2 kb片段测序挖掘出肌内脂肪含量相关的候选SNP位点,在杜洛克×长白猪×大白猪群体中对候选位点进行关联分析;通过荧光定量PCR检测关联位点不同基因型个体的CIDEA基因表达量和肌内脂肪标记基因脂肪酸结合蛋白4(FABP4)、脂肪酸结合蛋白3(FABP3)的表达量;双荧光素酶报告基因系统分析突变位点对CIDEA基因转录活性的影响。[结果]猪CIDEA基因上游调控区包含6个SNP位点,连锁分析后选择g.97268816 T>A,g.97269217 G>A和g.97269353 C>T三个标签SNP位点进行关联分析,发现g.97268816 T>A位点中AA基因型个体的肌内脂肪含量显著高于TT基因型个体(PA和g.97269353 C>T位点中三种基因型个体之间的肌内脂肪含量差异不显著(P>0.05)。而且,g.97268816 T>A位点中AA基因型个体的CIDEA基因表达水平显著高于TT基因型个体(P<0.05),而FABP4基因表达水平则显著高于TT基因型个体(P<0.01)和TA基因型个体(P<0.05)。双荧光素酶报告基因活性的结果显示AA型个体的荧光素酶活性极显著高于TT型个体(PA位点与猪的肌内脂肪含量显著相关,突变可以导致CIDEA基因的表达水平升高,进而影响猪的肌内脂肪含量。
【关键词】CIDEA 猪 肌内脂肪 变异 转录活性
【基金】中央高校基本科研业务费专项资金(KYYJ202008);; 转基因生物新品种培育重点课题(2018ZX0800928B);; 国家科技支撑计划(2015BAD03B01)资助
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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