大口黑鲈MsDmrt3的基因结构、系统进化及时空表达
2021-08-02分类号:S917.4
【部门】广东海洋大学水产学院 中国水产科学研究院珠江水产研究所农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室 上海海洋大学水产与生命学院
【摘要】基于大口黑鲈(Micropterus salmoides)全长转录组数据,克隆测序获得大口黑鲈MsDmrt3 cDNA序列,其开放阅读框为1245bp,共编码474个氨基酸,含有高保守的DM结构域和DMA结构域,且DM结构域有2个保守的锌指样结合位点。蛋白三维预测结构与人(Homo sapiens)和青鳉(Oryzias latipes)的DMRT3相似。结合大口黑鲈基因组数据分析显示,MsDmrt3位于基因组7号染色体上,基因序列长3353bp,由2个外显子与1个内含子组成。进化树聚类分析显示, Ms DMRT3属于DMRT3家族,且可能与低等节肢动物Dmrt93B起源于共同的原始DMRT。对大口黑鲈14种组织以及8个发育时期的MsDmrt3基因的表达情况进行定量分析,结果显示MsDmrt3基因在成熟个体的脊髓中高表达,精巢和眼次之,但在卵巢和肝脏几乎不表达;MsDmrt3在各发育时期均有表达,在6dpf前呈逐渐上调趋势,之后逐渐下调至最低水平。本研究表明, MsDmrt3基因序列与结构具有高保守性,且具有显著的性别表达二态性,推测其与性别决定和分化有关。同时,根据MsDmrt3基因在脊椎和胚胎发育早期的高表达,推测其可能在神经系统和胚胎早期生长发育中发挥作用。本研究旨在为大口黑鲈性别决定与性别分化分子机制的深入研究奠定基础。
【关键词】大口黑鲈 MsDmrt3基因 基因结构 系统进化分析 时空表达
【基金】财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-46);; 广东省重点领域研发计划项目(2021B020202000);; 中国水产科学研究院鳜鲈基因组学与选择技术创新团队专项(2020TD23);中国水产科学研究院珠江水产研究所鳜鲈基因组学与选择技术创新团队专项(2020ZJTD-02)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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