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马氏珠母贝C1qDC基因家族的鉴定及表达分析

2021-08-18分类号:S917.4

【作者】王菁  李桂英  林楷琪  刘付柏  李金凤  黄宝松  王忠良  
【部门】广东海洋大学水产学院  
【摘要】含C1q结构域蛋白(C1q domain containing, C1qDC)是经典补体途径的起始分子, 能够识别免疫复合物, 启动补体系统经典途径。本研究基于马氏珠母贝(Pinctada fucata)全基因组测序数据, 结合生物信息学方法对C1qDC基因进行了鉴定, 同时对其系统进化关系、序列结构、基序组成、染色体定位和基因家族成员的表达水平进行了分析。结果显示, 从马氏珠母贝全基因组数据中共鉴定出285个C1qDC基因; 根据系统进化关系聚集为5个亚类, 并不均匀分布在14条染色体上; 所有C1qDC序列均含有保守基序1。比较转录组数据分析显示, 在溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)攻毒4 h后, 马氏珠母贝C1qDC基因家族中有56个基因在血细胞中的表达水平发生了显著变化。其中, 上调表达基因32个, 下调表达基因24个。实时荧光定量PCR检测结果表明, 随机挑选的8个C1qDC基因的表达模式与转录组数据一致。以上研究结果为进一步解析马氏珠母贝C1qDC基因的进化模式及其在贝类免疫应答中的调控作用提供了理论基础。
【关键词】马氏珠母贝  含C1q结构域蛋白  基因家族  表达模式
【基金】广东省自然科学基金面上项目(2019A1515011875);; 广东省省级科技计划项目(国际科技合作领域)(2019A050510044);; 国家级大学生创新创业训练计划项目(CXXL2020002; 201810566001; CXXL2018001);; 广东海洋大学2019年“冲一流”省财政专项资金建设项;; 广东海洋大学“南海学者计划”(2017年度);; 广东海洋大学2021年度本科生创新团队项目(CXTD2021001)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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