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马氏珠母贝PEPCK 基因序列特征及其在耐低温品系的选择印记分析

2021-09-28分类号:S917.4

【作者】陈琨  赖卓欣  刘雅  郝瑞娟  王庆恒  
【部门】广东海洋大学水产学院  南方海洋科学与工程广东省实验室  广东省珍珠科技创新中心  
【摘要】磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(phosphoenolpyruvatecarboxykinase,PEPCK)是糖异生途径的关键酶,当动植物处于温度胁迫等不良环境条件时,它可通过催化草酰乙酸转化为磷酸烯醇式丙酮酸,继而生成葡萄糖以维持机体的血糖平衡,在抗逆过程中起着重要作用。本研究鉴定了马氏珠母贝(Pinctadafucatamartensii)的PEPCK基因,分析了低温胁迫下PmPEPCK表达量的变化,筛选和比较分析了马氏珠母贝耐低温选育系(lowtemperatureresistantline,R)F3和北部湾野生群体(BeibuGulfwildpopulation,W)的PmPEPCK外显子区的SNP位点。序列分析表明,PmPEPCK基因全长2557bp,5?UTR和3?UTR分别为56bp和466bp,开放阅读框2055bp,编码684个氨基酸。PmPEPCK在所检测组织中均有表达,其中肝胰腺表达量最高(P<0.05),说明PmPEPCK参与贝体的低温响应的过程。对PmPEPCK的外显子区SNP进行分析,共得到108个SNP,其中47个SNP位点的基因型频率在R和W群体间差异显著(P
【关键词】马氏珠母贝  PEPCK  低温耐受  SNP  基因克隆
【基金】广东省自然科学基金项目(2020A151501691);; 广东省现代农业产业技术体系-贝藻类产业创新团队(2020KJ146);; 广东省乡村振兴战略专项渔业产业发展(粤财农[2020]4号);; 广东省普通高校重点领域专项(2020ZDZX1045)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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