三角帆蚌溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶1 HcLPCAT1基因功能分析及壳色性状相关SNP筛选
2021-11-15分类号:S917.4
【部门】上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室 上海海洋大学水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心 上海海洋大学上海市水产养殖工程技术研究中心
【摘要】溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶1(LPCAT1)是一种重要的脂质代谢酶。为明确三角帆蚌(Hyriopsiscumingii)HcLPCAT1基因在类胡萝卜素代谢中的功能,探究该基因与三角帆蚌壳色的相关性,本研究采用RACE技术克隆获得HcLPCAT1基因cDNA全长1675 bp,ORF区1296 bp编码431个氨基酸;实时荧光定量分析发现HcLPCAT1基因在紫色三角帆蚌各组织中表达量均高于白色三角帆蚌相应组织,且在肝胰腺、外套膜中的表达量差异显著(P<0.01),同时相应组织中总类胡萝卜素含量(TCC)极显著升高(P<0.01)。采用直接测序法鉴定出三角帆蚌HcLPCAT1基因5个SNP位点的基因型与内壳色存在显著相关性(P<0.05),单倍型分析发现H1、H2两种单倍型为紫色三角帆蚌优势单倍型,H3、H5、H6三种单倍型为白色三角帆蚌优势单倍型。本研究鉴定的HcLPCAT1基因可为解析三角帆蚌类胡萝卜素代谢和壳色形成的机制提供研究基础,筛选出的与内壳色相关SNP及单倍型可用于分子辅助育种。
【关键词】三角帆蚌 LPCAT1基因 类胡萝卜素 SNP标记 内壳色
【基金】国家自然科学基金项目(31872565);; 财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助项目;; 上海市优秀学术带头人计划资助项目(19XD1421500)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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