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海底深部生物圈菌株泛酸枝芽孢杆菌19R1-5的来源和代谢特征分析

2021-11-24分类号:Q935;P73

【作者】胡新  王佳华  李江燕  方家松  
【部门】上海海洋大学海洋微生物学和生物地球化学实验室  夏威夷太平洋大学自然科学系  
【摘要】河流输送大量的陆源有机物、无机物和微生物到海洋,沉积到近海海盆。随着陆源和海源沉积物在盆地的逐渐堆积,这些陆源微生物被埋藏,进而逐渐演变为沉积物中固有微生物群体的一部分,是研究微生物环境适应与进化的理想生态系统。本课题组从国际大洋钻探计划(IODP) 337航次的一个西太平洋煤层岩芯(1,999 mbsf, meter below the seafloor)中,成功分离到一株革兰氏阳性细菌泛酸枝芽孢杆菌19R1-5(19R)。研究发现,19R与分离自陆源土壤的泛酸枝芽孢杆菌DSM 26(26~(T))相比,16S rRNA基因序列相似性为100%,DNA杂交同源性高达91.7%。我们将19R和26~(T)作为研究对象,从比较基因组的角度对19R的来源和代谢潜能进行研究。结果表明,分离自海底深部的19R来源于陆地;同时,19R较26~(T)拥有3个额外的磷酸葡萄糖转移酶系统(PTS),提示19R具有更强的糖利用能力,使之能够适应原位中特殊的营养环境,研究结果对探索海底深部生物圈微生物的来源及其在深海物质循环中的作用具有重要意义。
【关键词】海洋深部生物圈  系统发育学  基因组学  糖代谢  微生物
【基金】深部生物圈革兰氏阳性产孢子细菌孢子化及孢子活化的定量分析和碳同位素分馏研究(41773069);; 微生物驱动的海洋碳循环机制和生态过程研究(91951210);; National Key R&D Program of China(grant No.2018YFC0310600)
【所属期刊栏目】上海海洋大学学报
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