【摘要】以中国第34次南极科考采集的中山站附近海域5个站点海水样品为研究对象，通过Illumina高通量测序，鉴定微生物组成和微生物群落结构，发现取样的中山站海水中变形菌门（Proteobacteria）和拟杆菌门（Bacteroidetes）最为丰富，其次为蓝细菌（Cyanobacteria），属水平上黄杆菌属（Flavobacterium）和嗜冷杆菌属（Psychrobacter）含量最多，均超过20%。首次在南极海水中发现UBA1315属微生物，功能注释分析显示含有丰富的DNA修复基因，可能有助于适应南极恶劣环境。对中山站和罗斯海上层海水以及南北极不同地理位置海水微生物比较，发现变形菌门、拟杆菌门和蓝细菌在所有海水中普遍存在，变形菌门为优势菌，蓝细菌在南极海水中含量丰富，罗斯海上层海水比中山站海水微生物多样性丰富，且主要菌群丰度不同。本研究初步揭示了中山站附近海域微生物群落组成，为后续进一步研究南极中山站海水微生物资源调查和开发研究提供一定的基础数据。