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亚洲棉GaPP2C24基因的克隆及表达分析

2020-06-28分类号:S562

【作者】蔡肖  甄军波  刘琳琳  刘迪  唐丽媛  张素君  李兴河  王海涛  刘存敬  张香云  张建宏  迟吉娜  
【部门】河北省农林科学院棉花研究所农业农村部黄淮海半干旱区棉花生物学与遗传育种重点实验室国家棉花改良中心河北分中心  
【摘要】PP2C是一大类重要的蛋白磷酸酶,广泛参与不同的逆境胁迫响应。为了解PP2C基因在干旱响应中的功能,以亚洲棉石系亚1号为材料,利用RT-PCR方法从中克隆了GaPP2C24基因,并对该基因进行了生物信息学分析,荧光定量PCR研究了其在亚洲棉不同组织和干旱胁迫下的表达情况。结果表明,GaPP2C24基因CDS序列全长为1 251 bp,编码416个氨基酸。序列同源比对发现,GaPP2C24与其他植物的PP2C氨基酸序列有较高的相似性,其中与可可树(EOY33930.1)、黄麻(OMO91132.1)的相似性分别为85%,84%。进化分析表明,GaPP2C24与同属锦葵目的黄麻聚在一支,亲缘关系最近,与可可树的亲缘关系次之。实时荧光定量PCR结果表明,GaPP2C24基因在子叶、下胚轴、胚根、叶、茎和根均有表达,且在茎中的表达量最高,根中次之。GaPP2C24受干旱胁迫的诱导表达,其在根和叶片中的相对表达量在处理1 h后最高,分别达到对照的53.9,6.9倍,推测该基因在棉花干旱响应中有重要作用。
【关键词】亚洲棉  GaPP2C24  基因克隆  干旱胁迫  表达分析
【基金】河北省农林科学院基本科研业务费项目(2018070301);河北省农林科学院现代农业科技创新工程(2019-3-7) 河北省科技计划项目(16226303D)
【所属期刊栏目】华北农学报
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