东北七鳃鳗(Lethenteron morii)NF-κB基因启动子的构建及活性研究
2020-06-10分类号:S917.4
【部门】上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室 上海海洋大学中国科学技术部海洋生物科学国际联合研究中心 上海海洋大学水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心 密歇根州立大学渔业与野生生物系
【摘要】核转录因子NF-κB (nuclear factor kappa B)对机体的免疫反应、炎症反应等起重要的调控作用。为了获得NF-κB基因启动子的活性报告基因,进一步研究原始脊椎动物免疫应答的机制,我们根据此前克隆得到的东北七鳃鳗NF-κB基因的编码序列 (coding sequence,CDS),以与东北七鳃鳗高度同源的日本七鳃鳗同源基因 5’上游启动子特征序列为模板设计引物,克隆获得了东北七鳃鳗NF-κB启动子序列,该序列全长3 169 bp,提交至NCBI 数据库Genbank获得登录号MN368861。经AliBaba2.1软件预测该序列包含CREB (cgtgacttca)、Oct-1 (aatatgaatt)、GATA-1 (gaacctatct)、AP-1 (ggttgagtca)、NF-kappa B (ctttcctgtt)、IRF-1 (tttcctgttc)、Sp-1 (tgtgaggggt)、c-Jun (acgtgacttc)和c-Fos (ggttgagtca) 等多个转录因子结合位点,并包含TATA box转录核心元件。通过MethPrimer软件预测在序列1 207-1 402 bp处存在CG含量大于50%,长196 bp的CpG岛。利用双酶切技术构建了pGL3-NF-κB-pro重组质粒,并将其转染至人胚肾细胞(human embryonal kidney, HEK293T)和鲤上皮瘤细胞(Epithelioma papulosum cyprinid, EPC)中。双荧光素酶报告基因系统检测结果显示该片段序列在哺乳动物细胞系和鱼类细胞系中均具有启动子活性,同时在HEK293T中经过Toll样受体(Toll-like receptors,TLR)的配体LPS刺激后启动子活性显著上升。本研究成功构建了东北七鳃鳗NF-κB启动子报告基因,并在不同细胞系中证实了其活性。LPS刺激后的检测结果揭示东北七鳃鳗NF-κB参与了TLR信号通路的免疫应答。东北七鳃鳗NF-κB报告基因的构建为探究原始脊椎动物免疫系统信号传导机制奠定了基础。
【关键词】东北七鳃鳗 NF-κB 报告基因 启动子转录活性
【基金】教育部留学回国人员科研启动基金(D-8002-15-0042);; 中美海洋研究中心基金(A1-0209-15-0806);; 水产动物疾病与基因编辑育种的平台建设和前沿科学研究(A1-3201-19-3013)
【所属期刊栏目】水产学报
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