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浙江缢蛏群体糖原含量变化与GYS基因多态性的关联分析

2020-06-02分类号:S917.4

【作者】陈燕园  刘圣  何京  姚韩韩  林志华  董迎辉  
【部门】上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心  浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室  浙江万里学院宁海海洋生物种业研究院  
【摘要】为了探讨缢蛏糖原含量与糖原合酶基因(Sc-GYS)的特性及其用于分子标记辅助育种的可行性,本研究检测了浙江缢蛏群体糖原含量的周年变化,克隆获得糖原合酶基因的cDNA全长序列,分析其在不同组织、不同月份的表达差异,并进一步筛选出与糖原含量相关的SNP位点。结果显示,养殖缢蛏在2~6月糖原含量较高,4月达到最大值。Sc-GYS基因的cDNA全长为2 402 bp,开放阅读框为2 136 bp,编码711个氨基酸。荧光定量PCR结果显示,Sc-GYS基因主要在外套膜和足组织中表达,其不同月份的表达水平与糖原含量周年变化规律一致,4月份表达量显著高于其他月份,表明该基因与糖原合成关系密切。在“甬乐1号”品系和台州野生群体Sc-GYS基因的外显子区共筛选到2个与糖原含量相关的SNP位点,且两位点之间没有连锁不平衡,优势基因型组合个体的糖原含量比群体均值提高11.8%,这些位点和优势基因型组合可为缢蛏糖原含量的遗传改良提供候选标记。
【关键词】缢蛏  糖原  糖原合酶  SNP
【基金】国家贝类产业技术体系专项(CARS-49);; 国家水产种质资源平台运行服务项目(2019DKA30470);; 浙江省农业新品种选育重大科技专项(2016C02055-9);; 宁波市“科技创新2025”重大专项(2019B10005)
【所属期刊栏目】水产学报
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