【摘要】在"放管服"背景下,随着科研经费管理模式由监督管理向监督管理和规范服务转变、由项目负责人责任制向法人责任制转变、由过程控制向结果导向转变、由精细预算向包干预算转变,科研经费内部控制的重点也发生了变化,由项目层面为主的风险转变为单位层面为主的风险。在当前如何更好地对科研经费进行内部控制?文章分析了全面预算绩效管理对科研经费内部控制的有效性,提出将全面预算绩效管理的考核指标与内部控制风险点相结合,引导科研管理部门和科研人员通过完成考核指标来完善内部控制措施,从而达到内部控制目标,并采用案例法就上述情况进行了探讨。