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意大利蜜蜂工蜂中肠响应东方蜜蜂微孢子虫胁迫的可变剪接基因分析

2020-05-18分类号:S895

【作者】周倪红  王海朋  周丁丁  付中民  祝智威  范元婵  张曦  熊翠玲  郑燕珍  陈大福  郭睿  
【部门】福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)  枣庄职业学院  
【摘要】基于前期已获得的意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica)工蜂中肠转录组数据,在全转录组水平上对意大利蜜蜂的可变剪接基因(alternatively spliced gene, ASG)进行鉴定和分析,旨在揭示ASG在宿主响应东方蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)胁迫中的作用.在正常意大利蜜蜂7和10日龄工蜂中肠(Am7CK、Am10CK)和东方蜜蜂微孢子虫胁迫的意大利蜜蜂7和10日龄工蜂中肠(Am7T、Am10T)样品中检测到可变剪接事件数分别为73 383、85 618、79 813和74 693次,对应的基因数分别为9 586、10 063、9 829和9 622个,平均每个ASG上发生的可变剪接事件数分别为7.66、8.50、8.12和7.76次.各样品的可变剪接事件中外显子跨越的数量最多,分别为4 411、5 247、4 993和4 629个.Venn分析结果显示,Am7CK、Am10CK、Am7T和Am10T中的共有ASG数为9 056个,特有ASG数分别为100、153、275和95个.GO分类结果显示,这些共有ASG分布在50个功能条目,特有ASG分别分布于26、30、33和24个功能条目.KEGG代谢通路富集分析结果显示,上述共有ASG富集在325个代谢通路,包括内质网蛋白加工、核糖体和RNA转运等;特有ASG分别富集在31、104、126和22个代谢通路.研究结果提供了意大利蜜蜂响应东方蜜蜂微孢子虫胁迫过程中的ASG数量和种类信息,揭示宿主ASG在胁迫响应中参与了新陈代谢和细胞免疫,为关键ASG的筛选和功能研究建立了数据基础.
【关键词】意大利蜜蜂  工蜂  中肠  东方蜜蜂微孢子虫  胁迫  可变剪接
【基金】国家自然科学基金(31702190);; 现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-44-KXJ7);; 福建省自然科学基金项目(2018J05042);; 福建省教育厅中青年教师教育科研项目(JAT170158);; 福建农林大学杰出青年科研人才计划项目(xjq201814);福建农林大学科技创新专项基金项目(CXZX2017342、CXZX2017343)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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