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基于单链DNA浓度法的哈维氏弧菌核酸适配体亲和特异性研究

2020-05-15分类号:S941.4

【作者】彭英林  刘慧敏  鄢庆枇  王玮  许净  郑江  
【部门】集美大学水产学院鳗鲡现代产业技术教育部工程研究中心福建省水产生物育种与健康养殖工程研究中心  
【摘要】本研究采用核酸适配体的单链DNA浓度来表征其亲和力,通过测定核酸适配体与靶细菌哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)结合后ssDNA的浓度,来研究该核酸适配体的亲和特异性和亲和常数,并通过荧光显微镜法对其亲和特异性进行验证。结果显示,采用单链DNA浓度法测得该核酸适配体对靶细菌哈维氏弧菌的亲和力是非目标菌的15.2倍以上;荧光显微镜直接观察发现只有靶细菌能较好结合有荧光标记的核酸适配体,并呈现明显荧光;荧光阻断法发现靶细菌和非靶细菌都未呈现明显荧光,证明了该适配体有较好的亲和特异性,也进一步验证了单链DNA法的测定结果。在亲和常数的测定方面,利用单链DNA浓度法测得该核酸适配体的亲和常数K_d=(33.70±7.83) nmol/L,相应的拟合系数为R~2=0.960,有较好的准确性和可靠性,说明采用单链DNA浓度法来测定适配体的亲和力和亲和常数是可行的。
【关键词】核酸适配体  亲和特异性  ssDNA浓度  荧光显微镜
【基金】福建省自然科学基金项目(2018J01455);; 福建省科技厅鳗鲡现代产业技术教育部工程研究中心开放基金项目(RE201808);; 福建省水产生物育种与健康养殖工程研究中心开放基金课题(DF201901)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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