鳜pep和gh基因SNP标记与驯食性状的关联分析
2020-05-15分类号:S917.4
【部门】华中农业大学水产学院华中农业大学鳜鱼研究中心农业农村部鳜鱼育种创新基地农业农村部淡水生物繁育重点实验室 湖北省水产技术推广总站(湖北省水产良种引进繁育中心) 湖北省水产良种试验站
【摘要】以鳜(Siniperca chuatsi)选育群体为实验材料,在易驯食与不易驯食鳜转录组Unigene数据库中共预测到4809个SNP位点,其中胃蛋白酶基因(pepsinoge, pep)和生长激素基因(growth hormone, gh)均为转录组筛选获得的鳜驯食性状候选基因,本研究将候选基因上的多态SNP位点在易驯食和不易驯食鳜群体中进行基因分型,并与鳜驯食性状进行关联分析。在易驯食与不易驯食的鳜群体中共发现5个单核苷酸(SNP)多态性位点,有效等位基因(N_e)在1.1959~1.7001,观测杂合度(H_o)和期望杂合度(H_e)分别分布于0.1800~0.3585和0.1655~0.4160,多态信息含量(PIC)为0.2477,全部位点都属于中度多态性位点。结果表明SNP位点pep-A T/C中2种基因型TT和CT与鳜驯食性状呈高水平显著相关(P<0.05),显著影响鳜驯食性状表型,其中Genotype2相关性最高,可作为最优基因型个体进行选育。本研究在鳜pep和gh基因中鉴定出与驯食性状呈显著关联的SNP分子标记,为加快易驯食鳜新品种的基因辅助选育提供有效的SNP分子标记。
【关键词】翘嘴鳜 驯食性状 单核苷酸多态性(SNP) 关联分析
【基金】农业农村部现代农业产业技术体系专项资金资助项目(CARS-46);; 国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”项目(2018YFD0900400);; 武汉市青年科技晨光计划项目(2017050304010318)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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