青海省马铃薯Y病毒P1基因序列分析
2020-04-28分类号:S435.32
【部门】青海省农林科学院植物保护研究所青海省农业有害生物综合治理重点实验室
【摘要】【目的】本研究通过对不同PVY分离物基因的测序及分析,了解青海省PVY株系特点,进而对PVY病毒的分子检测和预防控制提供理论基础。【方法】采用RT-PCR扩增的方法,对青海省18个PVY的P1基因进行克隆测序和进化树分析。【结果】P1目的基因共825个碱基,编码275个氨基酸;经比对样品的P1基因序列,核酸一致率达90.3%~100.0%,其中Y-39、Y-47和Y-513个样品与其它样品有55~61个碱基的差异;试验样品与国内外已报道的PVY P1基因相比较,经进化树分组后,主要分为A、B、C 3组,其中A组包含了大部分来自青海的样品,是本地区的优势组群;而另一组4个样品的P1基因与本地优势组群有较大差异,且4个样品间也有一定的差异。通过与GeneBank中已上传的序列提供的信息相比对,发现14个样品的P1基因与PVY~(N-Wi)株系较近;其余4个样品与PVP~(NTN)株系较近。【结论】由P1基因分析表明,青海省马铃薯Y病毒株系具有地域特点,另外的4个样品说明青海PVY有可能是不同区域间种薯调运以及PVY本身重组特性而产生的。
【关键词】马铃薯Y病毒 P1基因 序列分析 青海
【基金】青海省自然科学基金项目(2018-ZJ-917);; 青海大学中青年科研基金项目(2014-QNY-7)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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