【摘要】公立医院是我国科研力量的重要组成,科研资金管理又是公立医院资金管理的重要组成部分,科学合理正确地组织会计核算,全面、完整地反映公立医院科研业务活动的运行状况,真实反映科研业务的运行结果,可以为公立医院改革和发展提供数据支持,建立适合公立医院健康发展的资金投入机制和运行机制。文章就政府会计制度实施后,医院科研资金的核算内容以及在实操层面存在的问题进行了探讨,相关建议有利于改进公立医院科研资金核算,对其他政府会计主体加强科研资金的会计核算亦有参考价值。