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水稻C24-甾醇甲基转移酶基因OsSMT2的生物信息学分析

2020-03-28分类号:S511

【作者】黄小龙  翟立升  闫慧清  
【部门】贵州师范大学贵州省植物生理与发育调控重点实验室  贵州师范大学国家林业局西南喀斯特山地生物多样性保护重点实验室  贵州师范大学生命科学学院  
【摘要】【目的】为水稻C-24甾醇甲基转移酶基因OsSMT2的进一步研究提供理论参考。【方法】以水稻OsSMT2基因为研究对象,通过生物信息学分析方法,对OsSMT2蛋白质的理化性质、结构特点、共表达基因的富集、启动子的顺式作用元件及表达模式等进行分析。【结果】水稻OsSMT2基因CDS全长1092 bp,编码1个含363个氨基酸的蛋白质,该蛋白质具有甲基转移酶结构域和甾醇甲基转移酶C末端结构域;OsSMT2蛋白质不含信号肽,存在1个跨膜结构域;OsSMT2基因的共表达基因主要富集到DNA的复制过程和次生代谢物的生物合成等途径中,可能参与植物的抗寒和抗旱过程;OsSMT2基因在萌发种子中的表达量最高,在叶片的表达量最低。【结论】水稻OsSMT2基因主要在萌发的种子、胚根、胚芽中高表达,参与水稻DNA复制和细胞分裂的主要过程,可作为水稻抗寒和抗旱育种的候选基因。
【关键词】水稻  C24-甾醇甲基转移酶  OsSMT2基因  生物信息学
【基金】贵州师范大学博士科研项目“水稻LAZY-LIKE基因的鉴定及其向重性调控研究”(11904-0514157);贵州师范大学研究生创新基金项目“水稻胚芽特异表达基因的生物信息学分析”[YC(2017)044]
【所属期刊栏目】西南农业学报
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