中国对虾NAGase基因SNP标记的筛选及与耐高pH性状的关联分析
2020-03-12分类号：S917.4
【部门】上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心 中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海水养殖病害防治重点实验室 青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室
【摘要】为探究N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶基因(NAGase)对中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)耐高pH性状的影响，本研究采用直接测序法及实时荧光定量PCR法检测FcNAGase的多态性，并分析其与中国对虾耐高pH性状的相关性。结果显示，通过直接测序的方法，在FcNAGase上共检测到29个潜在的SNP位点，分布频率为1.13/100 bp，其中，内含子的突变频率为0.35/100 bp，外显子的突变发生频率为0.78/100 bp。通过荧光定量PCR方法在中国对虾耐高pH性状分离群体中共检测到14个具有多态性的SNP位点，其中，观测杂合度(H_(o))为0.2581～0.9390，期望杂合度(H_(e))为0.0595～0.4490，多态信息含量(PIC)为0.0574～0.3731；利用卡方检验进行关联性分析，发现2个与中国对虾耐高pH性状显著相关的位点(P
【关键词】中国对虾 NAGase基因 耐高pH性状 SNP位点
【基金】国家虾蟹产业技术体系(CARS-48);; 山东省泰山产业领军人才工程项目(LNJY2015002);; 国家自然科学基金(31772842);; 山东省重点研发计划项目(2019QYTPY022)共同资助
【所属期刊栏目】渔业科学进展
文献传递
