【摘要】双会计核算基础下如何科学地管理核算科研项目?针对以往科研事业单位项目核算方式无法满足新政府会计制度管理需求,文章通过揭示新旧政府会计制度核算模式下的科研成本归集和固定资产折旧及分摊问题,阐明了新政府会计制度的特点和执行的必要性。对科研单位建立新的政府会计制度提出了新旧制度过渡流程和会计科目及平行分录的设定,对科研项目辅助核算则提出关联固定资产和固定资产累计折旧如何分配的建议。