【摘要】[目的]研究流感感染小鼠使用抗生素后肠道微生物、代谢物及肠道紧密连接蛋白的变化。[方法]30只雄性BALB/c小鼠随机分为3组：对照组、感染组和抗生素组。感染组和抗生素组同时感染流感病毒，抗生素组感染1 d后饮水中添加组合抗生素，3组小鼠感染9 d后取样。16S rRNA基因测序进行微生物组学分析；气相色谱-飞行时间质谱(GC-TOF/MS)进行代谢组学分析；免疫组化法和免疫印迹法进行结肠紧密连接蛋白的分析。[结果]感染组微生物多样性指数、细菌丰度和代谢物主成分分析(PCA)与对照组无显著差异。与感染组相比，抗生素组微生物多样性指数(Chao1，Shannon，Simpson)均显著下降(P<0.01)。拟杆菌门和变形菌门显著增加(P<0.01)，厚壁菌门显著减少(P<0.001)。抗生素组与对照组在PCA中完全分离，有机酸代谢与筛选差异出的微生物具有较强相关性。感染组和抗生素组紧密连接蛋白(Claudin-1，Occludin)的表达均显著减少(P<0.01)，抗生素组Claudin-1的表达与感染组相比显著减少(P<0.001)。[结论]抗生素降低肠道微生物的多样性，增加致病菌的侵入，减少有益菌的繁殖，加剧流感诱导的肠道菌群失调，减少有机酸的产生，导致更严重的肠道屏障功能损伤。