拟南芥核酸酶基因AtCaN2克隆及功能分析
2020-02-28分类号:Q943.2
【部门】湖北省农业科学院中药材研究所国家中药材产业技术体系恩施综合试验站 湖北省农业科技创新中心中药材分中心 东北林业大学盐碱地生物资源环境研究中心
【摘要】为了研究拟南芥核酸酶AtCaN2基因在植物生长发育过程中的作用与功能,从拟南芥中克隆了核酸酶AtCaN2基因,并对该基因进行生物信息学分析,亚细胞定位分析,蛋白质诱导、表达、纯化及功能研究。结果表明,AtCaN2蛋白等电点为8.45,化学式为C_(1116)H_(1788)N_(310)O_(335)S_3,共含有3 552个原子数,为亲水性蛋白;AtCaN2与十字花科亚麻荠的同源性较高,同源性为87.89%,与谷子、高粱和玉米的同源性较低,同源性分别是56.42%,57.35%,56.47%,且在氨基酸序列中间具有高度保守的D-X-D序列;同时进化树分析显示AtCaN2与十字花科亚麻荠的亲缘性最近,与谷子、玉米等禾本科植物的亲缘性比较远,这些结果同氨基酸序列比对的结果一致;亚细胞定位结果显示其定位于细胞质,与预测结果相符;蛋白质诱导和纯化得到大小约为35 ku的His-AtCaN2融合蛋白;Western Blot分析显示,诱导表达的融合蛋白正确翻译表达,且没有出现结构上的断裂或者降解的情况;小量诱导和大量诱导均有点突变后的His-AtCaN2(M)融合蛋白表达,且纯化后得到了点突变His-AtCaN2(M)较单一的条带;蛋白酶活性分析表明,His-AtCaN2融合蛋白对核酸底物具有降解能力,表现出较高的活性,而His-AtCaN2(M)点突变融合蛋白对核酸底物没有降解能力,底物基本上未降解。研究结果可以为下一步在植物体内研究AtCaN2基因的相关机理作用提供基础。
【关键词】拟南芥 核酸酶 AtCaN2 亚细胞定位 原核表达 酶活性
【基金】国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-21);; 湖北省中央引导地方科技发展专项(2018ZYYD013);; 湖北省技术创新专项(鄂西民族专项)(2017AKB075);; 恩施州科技计划研究与开发项目(D20180016)
【所属期刊栏目】华北农学报
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