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克雷伯氏菌果胶酸裂解酶基因K-PGL的获取与序列分析

2020-02-28分类号:Q936

【作者】孔卫青  杨金宏  
【部门】安康学院陕西省蚕桑重点实验室  
【摘要】【目的】研究克雷伯氏菌果胶酸裂解酶基因K-PGL的序列特征及其编码产物的理化性质、结构特征及同源性等。【方法】根据同源序列相似性设计引物,利用PCR、染色体步移等技术获得了基因序列,并对基因信号肽,疏水性和结构域等进行了分析。【结果】获得克雷伯氏菌2395 bp序列,其中K-PGL基因开放阅读框1710 bp,编码569个氨基酸,分子质量63.37 kDa,等电点7.17。编码蛋白具有信号肽酶切割位点,效率为0.864,序列中不含有半胱氨酸Cys,平均疏水指数为-0.449,为稳定存在的亲水蛋白。基因编码的蛋白具有内切聚半乳糖醛酸裂解酶基因家族特有的保守结构域,进化上与产酸克雷伯氏菌亲缘关系最近。【结论】获得了K-PGL基因序列及其特征,为进一步研究果胶酸裂解酶的生物学功能和应用提供依据。
【关键词】果胶酸裂解酶  克雷伯氏菌属  进化  序列分析
【基金】陕西省教育厅重点实验室项目(15JS002);; 秦巴山区生物资源综合开发协同创新中心项目[QBXTZ(P)-15-4]
【所属期刊栏目】西南农业学报
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