北京地区侵染菊花的番茄斑萎病毒分子检测与基因组部分序列分析
2020-02-28分类号:S436.8
【部门】天津市农业生物技术研究中心 北京市农业生物技术研究中心
【摘要】为了确定北京菊花产区是否发生了番茄斑萎病毒病,了解该病毒北京分离物的序列变异情况,对该地区发生的TSWV进行了分子检测,并对该病毒编码的依赖RNA的RNA聚合酶(RDRP)、多糖蛋白(Gn-Gc)、运动蛋白(NSm)、外壳蛋白(N)、非结构蛋白(NSs)等5个基因进行了序列分析。结果表明,TSWV北京地区菊花分离物(Beijing-jh)的5个编码基因与国内各分离物的进化关系较远,与来自韩国和西班牙的分离物亲缘关系较近。相似性分析表明,N基因是最为保守的基因,核酸平均相似性为97.2%,蛋白为98.6%,RDRP的变异性最大,核酸平均相似性为95.4%,蛋白为96.8%,且Beijing-jh分离物的5个基因编码的氨基酸与来自西班牙分离物的相似性最大,初步表明,该分离物可能是由于贸易活动由国外传入我国。
【关键词】菊花 番茄斑萎病毒 分子检测 序列分析
【基金】天津市种业科技重大专项(16ZXZYNC00070);; 天津市农科院青年创新基金(2015GA610);; 天津市企业科技特派员项目(19JCTPJC58400);; 天津市农业科技示范推广项目(201901020);; 天津市农业生物技术研究中心主任基金项目(2019003)
【所属期刊栏目】华北农学报
文献传递